Справочник фенотипических признаков растений создали ученые

Изображения растений содержат большое количество информации, отражающей ключевые фенотипические характеристики, такие как цвет, форма и состояние развития. Высокопроизводительная технология сбора фенотипов растений широко применяется в науке и практике. Эти данные могут служить важным ресурсом и в сельском хозяйстве, в том числе для идентификации вредителей и болезней растений.

Недавно Пекинский институт геномики Академии наук Китая (Китайский национальный центр биоинформатики) и Институт генетики и биологии развития Академии наук Китая совместно разработали открытый архив изображений и признаков растений OPIA, который предоставляет отечественным и зарубежным исследователям общедоступный сервис для отправки данных об изображениях и признаках растений и обмена ими. Исследование было опубликовано в Nucleic Acid Research.

Команда OPIA объединила 56 видов данных о растениях, охватывающих 11 видов и шесть типов тканей, с 566 225 изображениями и 2 417 186 аннотациями, используя стандартизированный процесс ручной обработки. Он включает 56 признаков 93 сортов риса и 105 сортов пшеницы на основе 18 644 отдельных изображений RGB. Эти признаки дополнительно аннотированы на основе фенотипа растений и «сшиты» с GWAS Atlas.

OPIA также предоставляет инструменты для предварительной обработки изображений и прогнозирования, помогающие при обработке данных пакетных изображений.

Благодаря использованию изображений и данных меток с различных типов датчиков исследователи смогут повысить точность интеллектуальных методов прогнозирования, выявить динамические законы развития растений, что будет способствовать инновациям и развитию глобальной феноменологии.