Группа исследователей из Университета Цукубы изучает последовательности генома двух древних предков томата, чтобы в дальнейшем использовать новые гены для получения более лучших и современных сортов.
Как и в случае с другими культурами, некоторые потенциально полезные гены, которые присутствовали у южноамериканских предков, были потеряны во время одомашнивания и разведения современного томата.
Команда из Университета Цукубы в сотрудничестве с TOKITA Seed Co. Ltd исследовала последовательности генома двух диких предков томатов из Перу, Solanum pimpinellifolium и Solanum lycopersicum var. cerasiforme.
Ученые использовали современные технологии секвенирования ДНК, которые могут считывать более длинные последовательности, в сочетании с передовыми инструментами биоинформатики для анализа сотен гигабайт сгенерированных данных и подтверждения высокого качества данных.
Исследователи продолжили анализ транскриптома генов предков томата, в которых ДНК передает в сообщения РНК. Они предоставляют инструкции для клетки по производству белков, исследуя 17 различных частей растений, чтобы показать, какие гены были активны. Вместе со сравнениями с известными генами эта информация указывает на возможные функции новых генов, например, в развитии плодов или придании устойчивости листьям к болезням или устойчивости к соли в корнях.
Подготовлено по материалам сайта tsukuba.ac.jp.