МРТ откроет новые возможности для сельского хозяйства

09.08.2021
Технологии
625

Группа ученых под руководством Texas A&M AgriLife использует магнитно-резонансную томографию (МРТ) для изучения корней сельскохозяйственных культур. Ученые считают, что исследование растений таким образом позволит в будущем создавать сорта и гибриды с более развитой коревой системой. Команда из Texas A&M AgriLife Research, Гарвардской медицинской школы, ABQMR Inc. и Института здоровья почвы разработала новую систему корневого фенотипирования на основе МРТ, благодаря чему у ученых появилась возможность получать изображения корневой системы растений в высоком разрешении.

Особенность технологии заключается в том, что МРТ выполняется фактически в полевых условиях, без повреждения корней. Для неразрушающего получения изображений корней растений, растущих в почве с высоким разрешением, и создала лабораторию Texas A&M Roots Lab. Дальнейшее развитие этой технологии как нового инструмента для оценки свойств корней сельскохозяйственных культур. Это часть программы наблюдений за ризосферой, оптимизированной для земной секвестрации (ROOTS), финансируемой через программу Агентства перспективных исследовательских проектов Министерства энергетики США — Энергетическая программа.

Нитья Раджан
«На сегодняшний день визуализация корней в почве является сложной задачей, потому что почва отличается сложной структурой, содержит твердые частицы, затрудняющие визуализацию. Благодаря МРТ мы имеем возможность видеть исключительно корневую систему сельскохозяйственных культур».
Нитья Раджан физиолог сельскохозяйственных культур AgriLife Research

От концепции до применения: МРТ поможет селекции в создании новых сортов

«На первом этапе мы провели исследования, доказывающие эффективность данной технологии. На втором этапе мы разработали ризотрон для МРТ с низким магнитным полем для получения изображений с высокой разрешающей способностью и специальных программ для широкого спектра сельскохозяйственных культур».
Нитья Раджан физиолог сельскохозяйственных культур AgriLife Research

Также в команду AgriLife Research входят Билл Руни, селекционер сорго и председатель Borlaug-Monsanto по селекции растений и международному улучшению сельскохозяйственных культур в Департаменте почвенных и сельскохозяйственных культур, и Джон Маллет, биохимик и председатель Перри Л. Адкиссона по сельскохозяйственной биологии  кафедры биохимии и биофизики.

«Нам необходимо создавать растения с корневыми системами, которые сохраняют больше углерода в почве. Кроме того, более глубокие корневые системы могут потреблять больше влаги из нижних слоев почвы, тем самым повышая устойчивость сельскохозяйственных культур к засухе».
Джон Маллет биохимик, соавтор исследования
МРТ позволяет изучать структуру и состояние корневой системы сельскохозяйственных культур без их повреждения.

С точки зрения улучшения характеристик сельскохозяйственных культур, данная технология необходима для эффективного скрининга зародышевой плазмы сельскохозяйственных культур на наличие определенных генотипов с улучшенной корневой системой.

По словам Раджана, использование МРТ позволяет исследователям собирать изображения корней, не повреждая растения, в отличие от традиционных методов, таких как рытье траншей, выкапывание почвы и выемка корней.

«При низких магнитных полях МРТ можно использовать для визуализации корней в естественных почвах. Низкие магнитные поля создают меньший риск для здоровья человека при работе с датчиком в сельскохозяйственных условиях».
Хилари Фабич соавтор исследования

В ходе исследования также был разработал первый прототип программного обеспечения под названием «MIDGARD» — 3D-сегментация МРТ и анализ описания корня  для извлечения количественной информации о признаках корня из МРТ-изображений корней.

Команда исследователей планирует выпустить MIDGARD как программное обеспечение с открытым исходным кодом после дальнейшего тестирования.

«Используя MIDGARD, мы можем извлечь количественную информацию о признаках корней, и эти данные будут использоваться для выбора идеальных характеристик растений. В будущем MIDGARD также будет иметь возможность трехмерного изображения содержания влаги в почве — ключевого свойства, которое стимулирует рост корней».

Ученые уже стали разрабатывать программу мероприятий для вывода новой технологии на рынок.